jembossctl: command not found

Maybe Your $PATH variable doesn't contain the default paths? echo $PATH should give something like:

[root@server ~]# echo $PATH
/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin

If it's empty, You may set the PATH variable with this command

export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin"

On Debian possible default full paths are:

/usr/bin/jembossctl - from package: emboss

You may install the required package with command apt-get install {package}

Error in other languages:
jembossctl: bevel nie gevind nie
jembossctl: comandă negăsită
jembossctl: comando não encontrado
jembossctl: commande introuvable
jembossctl: command not found
jembossctl: käsku ei ole
jembossctl: không tìm thấy lệnh
jembossctl: komanda nerasta
jembossctl: Kommando nicht gefunden.
jembossctl: kommandot finns inte
jembossctl: komut yok
jembossctl: nie znaleziono polecenia
jembossctl: níor aimsíodh an t-ordú
jembossctl: no se encontró la orden
jembossctl: no s'ha trobat l'ordre
jembossctl: opdracht niet gevonden
jembossctl: parancs nem található
jembossctl: perintah tidak ditemukan
jembossctl: príkaz nenájdený
jembossctl: příkaz nenalezen
jembossctl: команда не найдена
jembossctl: командата не е открита
jembossctl: 命令找不到
jembossctl: コマンドが見つかりません