estimate_response: command not found

Have You tried accessing the binary with the full path?

Maybe Your $PATH variable doesn't contain the default paths? echo $PATH should give something like:

[root@server ~]# echo $PATH
/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin

If it's empty, You may set the PATH variable with this command

export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin"

On Debian possible default full paths are:

/usr/lib/mrtrix/bin/estimate_response - from package: mrtrix

You may install the required package with command apt-get install {package}
Error in other languages:
estimate_response: bevel nie gevind nie
estimate_response: comandă negăsită
estimate_response: comando não encontrado
estimate_response: commande introuvable
estimate_response: command not found
estimate_response: käsku ei ole
estimate_response: không tìm thấy lệnh
estimate_response: komanda nerasta
estimate_response: Kommando nicht gefunden.
estimate_response: kommandot finns inte
estimate_response: komut yok
estimate_response: nie znaleziono polecenia
estimate_response: níor aimsíodh an t-ordú
estimate_response: no se encontró la orden
estimate_response: no s'ha trobat l'ordre
estimate_response: opdracht niet gevonden
estimate_response: parancs nem található
estimate_response: perintah tidak ditemukan
estimate_response: príkaz nenájdený
estimate_response: příkaz nenalezen
estimate_response: команда не найдена
estimate_response: командата не е открита
estimate_response: 命令找不到
estimate_response: コマンドが見つかりません