einsi: command not found

Maybe Your $PATH variable doesn't contain the default paths? echo $PATH should give something like:

[root@server ~]# echo $PATH
/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin

If it's empty, You may set the PATH variable with this command

export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin"

On Debian possible default full paths are:

/usr/lib/mafft/bin/einsi - from package: mafft

You may install the required package with command apt-get install {package}

Error in other languages:
einsi: bevel nie gevind nie
einsi: comandă negăsită
einsi: comando não encontrado
einsi: commande introuvable
einsi: command not found
einsi: käsku ei ole
einsi: không tìm thấy lệnh
einsi: komanda nerasta
einsi: Kommando nicht gefunden.
einsi: kommandot finns inte
einsi: komut yok
einsi: nie znaleziono polecenia
einsi: níor aimsíodh an t-ordú
einsi: no se encontró la orden
einsi: no s'ha trobat l'ordre
einsi: opdracht niet gevonden
einsi: parancs nem található
einsi: perintah tidak ditemukan
einsi: príkaz nenájdený
einsi: příkaz nenalezen
einsi: команда не найдена
einsi: командата не е открита
einsi: 命令找不到
einsi: コマンドが見つかりません