debruijn: command not found

Have You tried accessing the binary with the full path?

Maybe Your $PATH variable doesn't contain the default paths? echo $PATH should give something like:

[root@server ~]# echo $PATH
/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin

If it's empty, You may set the PATH variable with this command

export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin"

On Debian possible default full paths are:

/usr/bin/debruijn - from package: ncbi-tools-bin

You may install the required package with command apt-get install {package}
Error in other languages:
debruijn: bevel nie gevind nie
debruijn: comandă negăsită
debruijn: comando não encontrado
debruijn: commande introuvable
debruijn: command not found
debruijn: käsku ei ole
debruijn: không tìm thấy lệnh
debruijn: komanda nerasta
debruijn: Kommando nicht gefunden.
debruijn: kommandot finns inte
debruijn: komut yok
debruijn: nie znaleziono polecenia
debruijn: níor aimsíodh an t-ordú
debruijn: no se encontró la orden
debruijn: no s'ha trobat l'ordre
debruijn: opdracht niet gevonden
debruijn: parancs nem található
debruijn: perintah tidak ditemukan
debruijn: príkaz nenájdený
debruijn: příkaz nenalezen
debruijn: команда не найдена
debruijn: командата не е открита
debruijn: 命令找不到
debruijn: コマンドが見つかりません