cqa-compare-ref-rebuild: command not found

Have You tried accessing the binary with the full path?

Maybe Your $PATH variable doesn't contain the default paths? echo $PATH should give something like:

[root@server ~]# echo $PATH
/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin

If it's empty, You may set the PATH variable with this command

export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin"

On Debian possible default full paths are:

/usr/bin/cqa-compare-ref-rebuild - from package: collab-qa-tools

You may install the required package with command apt-get install {package}
Error in other languages:
cqa-compare-ref-rebuild: bevel nie gevind nie
cqa-compare-ref-rebuild: comandă negăsită
cqa-compare-ref-rebuild: comando não encontrado
cqa-compare-ref-rebuild: commande introuvable
cqa-compare-ref-rebuild: command not found
cqa-compare-ref-rebuild: käsku ei ole
cqa-compare-ref-rebuild: không tìm thấy lệnh
cqa-compare-ref-rebuild: komanda nerasta
cqa-compare-ref-rebuild: Kommando nicht gefunden.
cqa-compare-ref-rebuild: kommandot finns inte
cqa-compare-ref-rebuild: komut yok
cqa-compare-ref-rebuild: nie znaleziono polecenia
cqa-compare-ref-rebuild: níor aimsíodh an t-ordú
cqa-compare-ref-rebuild: no se encontró la orden
cqa-compare-ref-rebuild: no s'ha trobat l'ordre
cqa-compare-ref-rebuild: opdracht niet gevonden
cqa-compare-ref-rebuild: parancs nem található
cqa-compare-ref-rebuild: perintah tidak ditemukan
cqa-compare-ref-rebuild: príkaz nenájdený
cqa-compare-ref-rebuild: příkaz nenalezen
cqa-compare-ref-rebuild: команда не найдена
cqa-compare-ref-rebuild: командата не е открита
cqa-compare-ref-rebuild: 命令找不到
cqa-compare-ref-rebuild: コマンドが見つかりません