alimask: command not found

Maybe Your $PATH variable doesn't contain the default paths? echo $PATH should give something like:

[root@server ~]# echo $PATH
/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin

If it's empty, You may set the PATH variable with this command

export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin"

On Debian possible default full paths are:

/usr/bin/alimask - from package: hmmer

You may install the required package with command apt-get install {package}

Error in other languages:
alimask: bevel nie gevind nie
alimask: comandă negăsită
alimask: comando não encontrado
alimask: commande introuvable
alimask: command not found
alimask: käsku ei ole
alimask: không tìm thấy lệnh
alimask: komanda nerasta
alimask: Kommando nicht gefunden.
alimask: kommandot finns inte
alimask: komut yok
alimask: nie znaleziono polecenia
alimask: níor aimsíodh an t-ordú
alimask: no se encontró la orden
alimask: no s'ha trobat l'ordre
alimask: opdracht niet gevonden
alimask: parancs nem található
alimask: perintah tidak ditemukan
alimask: príkaz nenájdený
alimask: příkaz nenalezen
alimask: команда не найдена
alimask: командата не е открита
alimask: 命令找不到
alimask: コマンドが見つかりません