shnjoin: command not found

Have You tried accessing the binary with the full path?

Maybe Your $PATH variable doesn't contain the default paths? echo $PATH should give something like:

[root@server ~]# echo $PATH
/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin

If it's empty, You may set the PATH variable with this command

export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin"

On Debian possible default full paths are:

/usr/bin/shnjoin - from package: shntool

You may install the required package with command apt-get install {package}
Error in other languages:
shnjoin: bevel nie gevind nie
shnjoin: comandă negăsită
shnjoin: comando não encontrado
shnjoin: commande introuvable
shnjoin: command not found
shnjoin: käsku ei ole
shnjoin: không tìm thấy lệnh
shnjoin: komanda nerasta
shnjoin: Kommando nicht gefunden.
shnjoin: kommandot finns inte
shnjoin: komut yok
shnjoin: nie znaleziono polecenia
shnjoin: níor aimsíodh an t-ordú
shnjoin: no se encontró la orden
shnjoin: no s'ha trobat l'ordre
shnjoin: opdracht niet gevonden
shnjoin: parancs nem található
shnjoin: perintah tidak ditemukan
shnjoin: príkaz nenájdený
shnjoin: příkaz nenalezen
shnjoin: команда не найдена
shnjoin: командата не е открита
shnjoin: 命令找不到
shnjoin: コマンドが見つかりません