gt: command not found

Maybe Your $PATH variable doesn't contain the default paths? echo $PATH should give something like:

[root@server ~]# echo $PATH
/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin

If it's empty, You may set the PATH variable with this command

export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin"

On Debian possible default full paths are:

/usr/bin/gt - from package: genometools

You may install the required package with command apt-get install {package}

Error in other languages:
gt: bevel nie gevind nie
gt: comandă negăsită
gt: comando não encontrado
gt: commande introuvable
gt: command not found
gt: käsku ei ole
gt: không tìm thấy lệnh
gt: komanda nerasta
gt: Kommando nicht gefunden.
gt: kommandot finns inte
gt: komut yok
gt: nie znaleziono polecenia
gt: níor aimsíodh an t-ordú
gt: no se encontró la orden
gt: no s'ha trobat l'ordre
gt: opdracht niet gevonden
gt: parancs nem található
gt: perintah tidak ditemukan
gt: príkaz nenájdený
gt: příkaz nenalezen
gt: команда не найдена
gt: командата не е открита
gt: 命令找不到
gt: コマンドが見つかりません