dssp: command not found

Have You tried accessing the binary with the full path?

Maybe Your $PATH variable doesn't contain the default paths? echo $PATH should give something like:

[root@server ~]# echo $PATH
/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin

If it's empty, You may set the PATH variable with this command

export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin"

On Debian possible default full paths are:

/usr/bin/dssp - from package: dssp

You may install the required package with command apt-get install {package}
Error in other languages:
dssp: bevel nie gevind nie
dssp: comandă negăsită
dssp: comando não encontrado
dssp: commande introuvable
dssp: command not found
dssp: käsku ei ole
dssp: không tìm thấy lệnh
dssp: komanda nerasta
dssp: Kommando nicht gefunden.
dssp: kommandot finns inte
dssp: komut yok
dssp: nie znaleziono polecenia
dssp: níor aimsíodh an t-ordú
dssp: no se encontró la orden
dssp: no s'ha trobat l'ordre
dssp: opdracht niet gevonden
dssp: parancs nem található
dssp: perintah tidak ditemukan
dssp: príkaz nenájdený
dssp: příkaz nenalezen
dssp: команда не найдена
dssp: командата не е открита
dssp: 命令找不到
dssp: コマンドが見つかりません