bp_sreformat: command not found

Maybe Your $PATH variable doesn't contain the default paths? echo $PATH should give something like:

[root@server ~]# echo $PATH
/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin

If it's empty, You may set the PATH variable with this command

export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin"

On Debian possible default full paths are:

/usr/bin/bp_sreformat - from package: bioperl

You may install the required package with command apt-get install {package}

Error in other languages:
bp_sreformat: bevel nie gevind nie
bp_sreformat: comandă negăsită
bp_sreformat: comando não encontrado
bp_sreformat: commande introuvable
bp_sreformat: command not found
bp_sreformat: käsku ei ole
bp_sreformat: không tìm thấy lệnh
bp_sreformat: komanda nerasta
bp_sreformat: Kommando nicht gefunden.
bp_sreformat: kommandot finns inte
bp_sreformat: komut yok
bp_sreformat: nie znaleziono polecenia
bp_sreformat: níor aimsíodh an t-ordú
bp_sreformat: no se encontró la orden
bp_sreformat: no s'ha trobat l'ordre
bp_sreformat: opdracht niet gevonden
bp_sreformat: parancs nem található
bp_sreformat: perintah tidak ditemukan
bp_sreformat: príkaz nenájdený
bp_sreformat: příkaz nenalezen
bp_sreformat: команда не найдена
bp_sreformat: командата не е открита
bp_sreformat: 命令找不到
bp_sreformat: コマンドが見つかりません