srf2fasta: command not found

Have You tried accessing the binary with the full path?

Maybe Your $PATH variable doesn't contain the default paths? echo $PATH should give something like:

[root@server ~]# echo $PATH
/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin

If it's empty, You may set the PATH variable with this command

export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin"

On Debian possible default full paths are:

/usr/bin/srf2fasta - from package: staden-io-lib-utils

You may install the required package with command apt-get install {package}
Error in other languages:
srf2fasta: bevel nie gevind nie
srf2fasta: comandă negăsită
srf2fasta: comando não encontrado
srf2fasta: commande introuvable
srf2fasta: command not found
srf2fasta: käsku ei ole
srf2fasta: không tìm thấy lệnh
srf2fasta: komanda nerasta
srf2fasta: Kommando nicht gefunden.
srf2fasta: kommandot finns inte
srf2fasta: komut yok
srf2fasta: nie znaleziono polecenia
srf2fasta: níor aimsíodh an t-ordú
srf2fasta: no se encontró la orden
srf2fasta: no s'ha trobat l'ordre
srf2fasta: opdracht niet gevonden
srf2fasta: parancs nem található
srf2fasta: perintah tidak ditemukan
srf2fasta: príkaz nenájdený
srf2fasta: příkaz nenalezen
srf2fasta: команда не найдена
srf2fasta: командата не е открита
srf2fasta: 命令找不到
srf2fasta: コマンドが見つかりません