ConvertTraMLToTSV: command not found

Have You tried accessing the binary with the full path?

Maybe Your $PATH variable doesn't contain the default paths? echo $PATH should give something like:

[root@server ~]# echo $PATH

If it's empty, You may set the PATH variable with this command

export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin"

On Debian possible default full paths are:

/usr/bin/ConvertTraMLToTSV - from package: topp

You may install the required package with command apt-get install {package}
Error in other languages:
ConvertTraMLToTSV: bevel nie gevind nie
ConvertTraMLToTSV: comandă negăsită
ConvertTraMLToTSV: comando não encontrado
ConvertTraMLToTSV: commande introuvable
ConvertTraMLToTSV: command not found
ConvertTraMLToTSV: käsku ei ole
ConvertTraMLToTSV: không tìm thấy lệnh
ConvertTraMLToTSV: komanda nerasta
ConvertTraMLToTSV: Kommando nicht gefunden.
ConvertTraMLToTSV: kommandot finns inte
ConvertTraMLToTSV: komut yok
ConvertTraMLToTSV: nie znaleziono polecenia
ConvertTraMLToTSV: níor aimsíodh an t-ordú
ConvertTraMLToTSV: no se encontró la orden
ConvertTraMLToTSV: no s'ha trobat l'ordre
ConvertTraMLToTSV: opdracht niet gevonden
ConvertTraMLToTSV: parancs nem található
ConvertTraMLToTSV: perintah tidak ditemukan
ConvertTraMLToTSV: príkaz nenájdený
ConvertTraMLToTSV: příkaz nenalezen
ConvertTraMLToTSV: команда не найдена
ConvertTraMLToTSV: командата не е открита
ConvertTraMLToTSV: 命令找不到
ConvertTraMLToTSV: コマンドが見つかりません