Package: emboss

"emboss" package binaries on Debian:

/usr/bin/aaindexextract /usr/bin/abiview /usr/bin/acdc /usr/bin/acdgalaxy /usr/bin/acdlog /usr/bin/acdpretty /usr/bin/acdtable /usr/bin/acdtrace /usr/bin/acdvalid /usr/bin/aligncopy /usr/bin/aligncopypair /usr/bin/antigenic /usr/bin/assemblyget /usr/bin/backtranambig /usr/bin/backtranseq /usr/bin/banana /usr/bin/biosed /usr/bin/btwisted /usr/bin/cachedas /usr/bin/cachedbfetch /usr/bin/cacheebeyesearch /usr/bin/cacheensembl /usr/bin/cai /usr/bin/chaos /usr/bin/charge /usr/bin/checktrans /usr/bin/chips /usr/bin/cirdna /usr/bin/codcmp /usr/bin/codcopy /usr/bin/coderet /usr/bin/compseq /usr/bin/consambig /usr/bin/cpgplot /usr/bin/cpgreport /usr/bin/cusp /usr/bin/cutgextract /usr/bin/cutseq /usr/bin/dan /usr/bin/dbiblast /usr/bin/dbifasta /usr/bin/dbiflat /usr/bin/dbigcg /usr/bin/dbtell /usr/bin/dbxcompress /usr/bin/dbxedam /usr/bin/dbxfasta /usr/bin/dbxflat /usr/bin/dbxgcg /usr/bin/dbxobo /usr/bin/dbxreport /usr/bin/dbxresource /usr/bin/dbxstat /usr/bin/dbxtax /usr/bin/dbxuncompress /usr/bin/degapseq /usr/bin/density /usr/bin/descseq /usr/bin/diffseq /usr/bin/distmat /usr/bin/dotmatcher /usr/bin/dotpath /usr/bin/dottup /usr/bin/dreg /usr/bin/drfinddata /usr/bin/drfindformat /usr/bin/drfindid /usr/bin/drfindresource /usr/bin/drget /usr/bin/drtext /usr/bin/edamdef /usr/bin/edamhasinput /usr/bin/edamhasoutput /usr/bin/edamisformat /usr/bin/edamisid /usr/bin/edamname /usr/bin/edialign /usr/bin/einverted /usr/bin/embossdata /usr/bin/embossupdate /usr/bin/embossversion /usr/bin/em_cons /usr/bin/emma /usr/bin/emowse /usr/bin/em_pscan /usr/bin/entret /usr/bin/epestfind /usr/bin/eprimer32 /usr/bin/eprimer3 /usr/bin/equicktandem /usr/bin/est2genome /usr/bin/etandem /usr/bin/extractalign /usr/bin/extractfeat /usr/bin/extractseq /usr/bin/featcopy /usr/bin/featmerge /usr/bin/featreport /usr/bin/feattext /usr/bin/findkm /usr/bin/freak /usr/bin/fuzznuc /usr/bin/fuzzpro /usr/bin/fuzztran /usr/bin/garnier /usr/bin/geecee /usr/bin/getorf /usr/bin/godef /usr/bin/goname /usr/bin/helixturnhelix /usr/bin/hmoment /usr/bin/iep /usr/bin/infoalign /usr/bin/infoassembly /usr/bin/infobase /usr/bin/inforesidue /usr/bin/infoseq /usr/bin/isochore /usr/bin/jaspextract /usr/bin/jaspscan /usr/bin/jembossctl /usr/bin/lindna /usr/bin/listor /usr/bin/makenucseq /usr/bin/makeprotseq /usr/bin/marscan /usr/bin/maskambignuc /usr/bin/maskambigprot /usr/bin/maskfeat /usr/bin/maskseq /usr/bin/matcher /usr/bin/megamerger /usr/bin/merger /usr/bin/msbar /usr/bin/mwcontam /usr/bin/mwfilter /usr/bin/needleall /usr/bin/needle /usr/bin/newcpgreport /usr/bin/newcpgseek /usr/bin/newseq /usr/bin/nohtml /usr/bin/noreturn /usr/bin/nospace /usr/bin/notab /usr/bin/notseq /usr/bin/nthseq /usr/bin/nthseqset /usr/bin/octanol /usr/bin/oddcomp /usr/bin/ontocount /usr/bin/ontogetcommon /usr/bin/ontoget /usr/bin/ontogetdown /usr/bin/ontogetobsolete /usr/bin/ontogetroot /usr/bin/ontogetsibs /usr/bin/ontogetup /usr/bin/ontoisobsolete /usr/bin/ontotext /usr/bin/palindrome /usr/bin/pasteseq /usr/bin/patmatdb /usr/bin/patmatmotifs /usr/bin/pepcoil /usr/bin/pepdigest /usr/bin/pepinfo /usr/bin/pepnet /usr/bin/pepstats /usr/bin/pepwheel /usr/bin/pepwindowall /usr/bin/pepwindow /usr/bin/plotcon /usr/bin/plotorf /usr/bin/polydot /usr/bin/preg /usr/bin/prettyplot /usr/bin/prettyseq /usr/bin/primersearch /usr/bin/printsextract /usr/bin/profit /usr/bin/prophecy /usr/bin/prophet /usr/bin/prosextract /usr/bin/psiphi /usr/bin/rebaseextract /usr/bin/recoder /usr/bin/redata /usr/bin/refseqget /usr/bin/remap /usr/bin/restover /usr/bin/restrict /usr/bin/revseq /usr/bin/seealso /usr/bin/seqcount /usr/bin/seqmatchall /usr/bin/seqret /usr/bin/seqretsetall /usr/bin/seqretsplit /usr/bin/seqxref /usr/bin/seqxrefget /usr/bin/servertell /usr/bin/showalign /usr/bin/showdb /usr/bin/showfeat /usr/bin/showorf /usr/bin/showpep /usr/bin/showseq /usr/bin/showserver /usr/bin/shuffleseq /usr/bin/sigcleave /usr/bin/silent /usr/bin/sirna /usr/bin/sixpack /usr/bin/sizeseq /usr/bin/skipredundant /usr/bin/skipseq /usr/bin/splitsource /usr/bin/splitter /usr/bin/stretcher /usr/bin/stssearch /usr/bin/supermatcher /usr/bin/syco /usr/bin/taxget /usr/bin/taxgetdown /usr/bin/taxgetrank /usr/bin/taxgetspecies /usr/bin/taxgetup /usr/bin/tcode /usr/bin/textget /usr/bin/textsearch /usr/bin/tfextract /usr/bin/tfm /usr/bin/tfscan /usr/bin/tmap /usr/bin/tranalign /usr/bin/transeq /usr/bin/trimest /usr/bin/trimseq /usr/bin/trimspace /usr/bin/twofeat /usr/bin/union /usr/bin/urlget /usr/bin/variationget /usr/bin/vectorstrip /usr/bin/water /usr/bin/whichdb /usr/bin/wobble /usr/bin/wordcount /usr/bin/wordfinder /usr/bin/wordmatch /usr/bin/wossdata /usr/bin/wossinput /usr/bin/wossname /usr/bin/wossoperation /usr/bin/wossoutput /usr/bin/wossparam /usr/bin/wosstopic /usr/bin/xmlget /usr/bin/xmltext /usr/bin/yank

You may install this package on Debian with apt-get install emboss