parrec2nii: command not found

Have You tried accessing the binary with the full path?

Maybe Your $PATH variable doesn't contain the default paths? echo $PATH should give something like:

[root@server ~]# echo $PATH
/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin

If it's empty, You may set the PATH variable with this command

export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin"

On Debian possible default full paths are:

/usr/bin/parrec2nii - from package: python-nibabel

You may install the required package with command apt-get install {package}
Error in other languages:
parrec2nii: bevel nie gevind nie
parrec2nii: comandă negăsită
parrec2nii: comando não encontrado
parrec2nii: commande introuvable
parrec2nii: command not found
parrec2nii: käsku ei ole
parrec2nii: không tìm thấy lệnh
parrec2nii: komanda nerasta
parrec2nii: Kommando nicht gefunden.
parrec2nii: kommandot finns inte
parrec2nii: komut yok
parrec2nii: nie znaleziono polecenia
parrec2nii: níor aimsíodh an t-ordú
parrec2nii: no se encontró la orden
parrec2nii: no s'ha trobat l'ordre
parrec2nii: opdracht niet gevonden
parrec2nii: parancs nem található
parrec2nii: perintah tidak ditemukan
parrec2nii: príkaz nenájdený
parrec2nii: příkaz nenalezen
parrec2nii: команда не найдена
parrec2nii: командата не е открита
parrec2nii: 命令找不到
parrec2nii: コマンドが見つかりません