blastn: command not found

Maybe Your $PATH variable doesn't contain the default paths? echo $PATH should give something like:

[root@server ~]# echo $PATH
/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin

If it's empty, You may set the PATH variable with this command

export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin"

On Debian possible default full paths are:

/usr/bin/blastn - from package: ncbi-blast+

You may install the required package with command apt-get install {package}

Error in other languages:
blastn: bevel nie gevind nie
blastn: comandă negăsită
blastn: comando não encontrado
blastn: commande introuvable
blastn: command not found
blastn: käsku ei ole
blastn: không tìm thấy lệnh
blastn: komanda nerasta
blastn: Kommando nicht gefunden.
blastn: kommandot finns inte
blastn: komut yok
blastn: nie znaleziono polecenia
blastn: níor aimsíodh an t-ordú
blastn: no se encontró la orden
blastn: no s'ha trobat l'ordre
blastn: opdracht niet gevonden
blastn: parancs nem található
blastn: perintah tidak ditemukan
blastn: príkaz nenájdený
blastn: příkaz nenalezen
blastn: команда не найдена
blastn: командата не е открита
blastn: 命令找不到
blastn: コマンドが見つかりません